С аванса можно удержать НДФЛ, который компания ранее исчислила с материальной выгоды и натурального дохода.

Минфин неоднократно заявлял, что начислять и удерживать НДФЛ с аванса нельзя. Ведь дата получения дохода по зарплате – последний день месяца, за который она начислена (письмо Минфина от 25.07.2016 № 03-04-06/43463).

Но если к моменту выдачи аванса компания исчислила НДФЛ с неденежных доходов, то она может удержать его с аванса. Так как аванс – это доход работника. А налог с материальной выгоды, доходов в натуральной форме нужно удержать из ближайших денежных доходов.

Другая ситуация, когда компания выдает сотруднику заем. Выплата не облагается налогом. Поэтому удерживать с займа налог, который компания исчислила с выгоды или подарка, нельзя.

Подробнее: Письмо Минфина России от 05.05.2017 № 03-04-06/28037.