Компания должна выставить корректировочный счет-фактуру, если стоимость уже отгруженного товара изменилась. В документе нужно указать реквизиты первоначального счета-фактуры и разницу между показателями. После чего документ регистрируют в книге покупок или продаж.

Но не исключено, что стоимость придется поменять повторно. Например, снова изменились цены или уточнили количество товара. Тогда корректировочный счет-фактуру нужно выставить снова. Причем, запись о предшествующем документе в книге покупок или книге продаж не аннулируют. Такие разъяснения привели специалисты ФНС России в письме от 27.03.2013 г. № ЕД-4-3/5306.